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염색체와 복부 대동맥 동맥류

#^. 2020. 8. 4. 23:30

염색체와 복부 대동맥 동맥류에 대립 유전자의 연관 복부 대동맥 동맥류 (AAA)는 유전 적 및 환경 적 위험 요소를 모두 갖는 다 인성 질환으로 인식되어왔다. 염색체의 비 암호화 DNA 내에있는 유전자좌는 최근에 AAA와 관련이 있습니다. 그러나 효과 크기는 유전 적 및 환경 적 구성 요소를 갖는 다 인성 질환으로서 AAA에 대한 현재의 이해와 일치한다. 이 연구는 또한 LINE-1 요소와 AAA의 연관성에 대한 예비 증거를 제공합니다. 우리 의 실리코분석 결과 rs10757278 또는 rs1333049에 인접한 LINE-1 삽입은 이러한 SNP와 AAA의 연관성을 설명 할 수 있다고 제안했습니다. 그러나, 예측 된 부위에서 이들 후보 LINE-1의 삽입을 확인하면서, 평가 된 대상체에서 삽입 다형성이 발견되지 않았다. 그러나 LINE-1에 대한 mRNA가 AAA 생검 내에서 상향 조절되었다는 것을 증명했다. 9 개의 전장 LINE-1이 L1Xplorer에 따라 9p21.3 영역에 삽입 될 것으로 예측되었다. 5개의 삽입물은 계통 발생적으로 오래된 2 개의 더 젊은 L1PA2 및 2 개의 비정규 요소였다. 프라이머는 후보 유전자에 상응하는 하나의 더 오래된 요소의 다운 스트림 및 업스트림 방향에있는 두 개의 더 젊은 L1PA2를 위해 설계되었습니다. 3 개의 전장 LINE-1은 모두 평가 된 100 명의 대상체에서 삽입 다형성이없는 확실한 삽입으로 확인되었다. 및 APOBEC3B : 0.66 vs. 0.40, p = 0.019). 중요하게는 발현은 높은 상관 관계가 있었다 (r = 0.96, 95 % CI 0.90-0.98, p <0.001). AAA 신체 생검 내 억제제 APOBEC3B 유전자의 발현은 ORF1 (r = 0.66, 95 % CI 0.34-0.84, p <001) 및 ORF2 (r = 0.72, 95 % CI 0.44-0.87, p <0.001)와 상관 관계가 있었다. AAA 생검 내에서 발현 수준과 대립 유전자 빈도 사이의 연관성이 없음을 발견 하였다. 그러나, 다형성에 의해 형성된 GG 일배 체형은 인간 AAA의 신체로부터의 생검에서 ORF1 및 ORF2 둘 다의 증가 된 발현과 유의하게 관련되었다. 거시적으로 정상인 AAA 목으로부터의 생검에서 체형 및 ORF1 또는 ORF2 발현 사이에는 연관성이 발견되지 않았다.복부 대동맥 동맥 류 (AAA)와 단일 뉴클레오티드 다형성, 식별 된 염색체 9p21.3 유전자 좌의 연관성은 원래 7 개의 다른 인구에서 유래 한 개인에 대해 수행 된 다중 센터 사례 제어 연구에서 인정되었습니다. AAA와의 가장 중요한 연관성은 아이슬란드 그룹에서 발견되었습니다 (홀수 비율 (OR) ~ 1.4, p = 2.6 × 10-5). 7 개의 코호트 중 5 개에서 유의미한 연관성이 발견되었다.

AAA에 대한이 사이트의 중요성을 추가로 조사하기 위해 65-83 세의 3,371 명의 큰 그룹에서 513 명이 AAA를 가진 협회에 대한 연구를 수행했습니다. 양식모든 남성은 다른 위험 인자를 균일 한 방식으로 평가하고 복부 대동맥의 초음파를 수행했습니다. 우리의 연구 결과 AAA와 염색체 9p21.3 SNPs rs10757278 및 rs1333049의 강한 협회를 확인 하 고 AAA 사이트에서 LINE-1 요소을 시연했다. 우리분석 에 기초하여, 우리위험 대립 유전자가 LINE-1 요소와 연관 될 수 있고 대동맥 생검 내에서이 이론을 뒷받침 할 증거를 찾았다 고 가정했습니다. 염색체 9p21.3의 위험 유전자좌와 AAA의 중요한 연관성을 확인시켜줍니다. 임상 적 관점에서, 작은 효과 크기 및이 위험 유전자좌가 비-코딩 DNA의 세그먼트 내에 존재한다는 사실은이 다형성의 진단, 예후 및 치료 적 적용을 제한한다.  알려진 관상 동맥 심장 질환을 가진 대상체를 배제한 추가 분석으로 대부분의 그룹에 대해보고 된 연관성의 유의성이 현저하게 감소되었다. 이것은이 연관성이 죽상 동맥 경화증 및 / 또는 그 위험 인자와의 혼란을 단순히 반영 할 가능성을 높인다. 보다 최근의 연구에 따르면 OR이 ~ 2 인 영국 인구에서 rs1333049와 AAA의 연관성이보고되었습니다. 연구자들은 흡연, 이상 지질 혈증, 관상 동맥 심장 질환, 연령 및 가족력을 ​​포함한 다른 AAA 위험 요소를 조정 한 후에도이 연관성이 유지되었다고보고했지만, 대상의 절반 만이이 분석에 대한 위험 요소 데이터를 가졌습니다. 추가적인 사례 관리 연구에는 영국과 서호주의 개인이 포함되었으며, rs10757278과 AAA 사이에는 유의 한 연관성이 없었으나, 이전 연구에서 발견 된 OR과 일치하는 결과가있었습니다 염색체 9p21.3 위험 유전자좌는 비 코딩 DNA 내에 존재하는 것으로 여겨진다. 인간 게놈의 대부분은 반복적 인 DNA이며, 이러한 반복적 인 서열의 대부분은 레트로 트랜스 포손을 나타내고; 숙주 게놈 내에서 반복적으로 전이되는 이동성 유전자 요소의 클래스. 그 중에서도, 긴 산재 된 핵 요소 1 (LINE-1)은 인간 게놈의 광범위한 변이를 매개하는 것으로 알려져 있으며, 이들의 침습성으로 인해 다중 표현형 특성에 영향을 미치는 다 항성 효과가 발생할 수있다.